星晶獣の噂を追って主人公たちが辿り着いたメネア皇国では、ゴブリン族との戦争が起きようとしていた。ゴブリン族が巣食う昏き島に、“光の巨人”と呼ばれる星晶獣ヘカトンケイルが眠ると知り、ゴブリン討伐隊に加わる一行。

一行は同じ討伐隊に所属する、傭兵のフィーナ、ゴブリン族に復讐を誓う兄妹・ルシウスとティナと出会い、行動をともにするようになる。

しかし、一行の乗る騎空艇がゴブリン達に急襲され……